Proces beatyfikacyjny

Proces beatyfikacyjny rozpoczęty został w Pelplinie w 1964 r., a zakończony na etapie diecezjalnym w Toruniu 18 lutego 1995.
7 czerwca 1999 podczas pobytu w Toruniu, Jan Paweł II dokonał beatyfikacji Sługi Bożego ks. S. W. Frelichowskiego.
Relikwiarz błogosławionego wręczył Ojcu Swiętemu pan Stanisław Bieńka – ten sam który w obozie wykonał maskę pośmiertną i ukrył w niej relikwie.

Fragment wypowiedzi Jana Pawła II podczas Beatyfikacji ks. Stefana Frelichowskiego:

„Dzielmy się tym Bożym pokojem z innymi, tak jak to czynił bł. Kapłan i męczennik Wincenty Frelichowski. W ten sposób staniemy się zaczynem pokoju w świecie, społeczeństwie, w środowisku, w którym żyjemy i pracujemy.”